В эксперименте с липой зависимой переменной является цвет древесины, а независимой - состав воды. Для постановки отрицательного контроля необходимо наблюдать за цветом древесины в чистой воде. Такой контроль позволяет установить, влияет ли состав воды на окраску древесины.